Согласно Уставу, управление деятельностью МБДОУ осуществляется в соответствии с действующим законодательством Российской Федерации, на принципах единоначалия и коллегиальности. Руководство деятельностью учреждения осуществляется заведующим, который назначается на должность и освобождается от должности Учредителем.
В учреждении функционируют следующие коллегиальные органы управления:
Педагогический совет Положение о педагогическом совете МБДОУ "Кугесьский детский сад "Ягодка" Чебоксарского района Чувашской Республики
Общее собрание работников Положение об общем собрании работников
Управляющий совет Положение об Управляющем совете
Филиалов и структурных подразделений нет.